La Biblioteca-Centro documentale IAMB nasce dalla necessità di dotare il corpo docente e gli studenti del primo corso di irrigazione, nell’anno accademico 1961-1962, di materiale didattico e sussidiario, quando la sede dell'Istituto era nel campus della Facoltà di Agraria dell’Università di Bari, in Via Amendola, nella palazzina del Collegio universitario.
Prima responsabile della biblioteca è la signorina Patrizia Intraccolo, poi trasferita a Bruxelles alla Comunità Europea.
Il 10 aprile 2002 viene inaugurata l’attuale sede del Centro Documentale, nella palazzina E, alle spalle dell’Aula Magna.
A tagliare il nastro l'allora Segretario Generale del CIHEAM, Enzo Chioccioli.